aCGH

DOI:10.18129 / B9.bioc.aCGH

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅aCGH。

阵列比较基因组杂交数据的类和函数

Bioconductor版本:3.15

从图像分析功能阅读aCGH数据输出文件和克隆信息文件,创建aCGH S3对象来存储这些数据。基本方法来访问/替换,构造子集、印刷和策划aCGH对象。

作者:简Fridlyand < jfridlyand cc.ucsf.edu >,彼得季米特洛夫季米特洛夫< stat.Berkeley.EDU >

季米特洛夫维护者:彼得季米特洛夫< stat.Berkeley.EDU >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“aCGH”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“aCGH”)

PDF	R脚本	aCGH概述
PDF		参考手册

细节

biocViews	CopyNumberVariation,DataImport,遗传学,软件
版本	1.74.0
Bioconductor自	BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 17.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 2.10),集群,生存,乘
进口	BiobasegrDevices图形,方法、统计数据、样条函数,跑龙套
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	CRImage
进口我	ADaCGH2,rCGH,snapCGH
建议我	beadarraySNP
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	aCGH_1.74.0.tar.gz
Windows二进制	aCGH_1.74.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	aCGH_1.74.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/aCGH
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ aCGH
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/aCGH/
包下载报告	下载数据