ToxicoGx

DOI:10.18129 / B9.bioc.ToxicoGx

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ToxicoGx。

分析大规模Toxico-Genomic数据

Bioconductor版本:3.15

包含一组函数执行大规模toxicogenomic数据的分析,提供一个标准化的数据结构来保存信息相关注释,toxicogenomic数据的可视化和统计分析。

作者:Sisira Nair (aut),以斯帖Yoo (aut),克里斯托弗•伊尔斯(aut)艾米唐(aut) Nehme El-Hachem (aut),切赫斯米尔诺夫(aut),本杰明Haibe-Kains (aut (cre)

维护人员:本杰明Haibe-Kains < benjamin.haibe。实物地租在utoronto.ca >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ToxicoGx”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes (“ToxicoGx”)

HTML	R脚本	ToxicoGx: R Toxicogenomics综合数据分析平台
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	GeneExpression,遗传药理学,药物基因组学,软件
版本	2.0.0
Bioconductor自	BioC 3.12 (r - 4.0)(2年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 4.1),CoreGx
进口	SummarizedExperiment,BiocGenerics,S4Vectors,Biobase,BiocParallel,ggplot2,宠物猫,dplyr,caTools,下载器,magrittr、方法、reshape2,tidyr,data.table,为了,尺度、图形、grDevices平行,统计,跑龙套,limma,jsonlite
链接
建议	rmarkdown,testthat,BiocStyle,knitr,tinytex,devtools,PharmacoGx,xtable,减价
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	ToxicoGx_2.0.0.tar.gz
Windows二进制	ToxicoGx_2.0.0.zip
macOS二进制(x86_64)	ToxicoGx_2.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ToxicoGx
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ToxicoGx
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ToxicoGx/
包下载报告	下载数据