TargetScore

DOI:10.18129 / B9.bioc.TargetScore

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅TargetScore。

TargetScore:推断microRNA目标使用microRNA-overexpression数据和序列信息

Bioconductor版本:3.15

推断出微目标的后验分布概率模型的可能性microRNA-overexpression fold-changes和基于分数。Variaitonal贝叶斯高斯混合模型(VB-GMM)应用于日志fold-changes和序列的分数获得潜变量的后验microrna的目标。最后计算targetScore sigmoid-transformed叠化加权平均后验的目标组件的所有功能。

作者:李曰

维护人员:李曰< yueli cs.toronto.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“TargetScore”)

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文档

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PDF	R脚本	TargetScore:推断microRNA目标使用microRNA-overexpression数据和序列信息
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文本		新闻

细节

biocViews	软件,microrna的
版本	1.34.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(9年)
许可证	GPL-2
取决于	pracma,矩阵
进口
链接
建议	TargetScoreData,gplots,Biobase,GEOquery
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.cs.utoronto.ca/ ~ yueli / software.html
取决于我
进口我
建议我	TargetScoreData
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	TargetScore_1.34.0.tar.gz
Windows二进制	TargetScore_1.34.0.zip
macOS二进制(x86_64)	TargetScore_1.34.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TargetScore
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ TargetScore
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/TargetScore/
包下载报告	下载数据