锡
DOI:10.18129 / B9.bioc.TIN
这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅锡。
转录组不稳定分析
Bioconductor版本:3.15
锡包实现了一套基于外显子表达谱的转录组不稳定分析的工具。偏离使用外显子剪接的上下文中研究转录组分析到什么程度不稳定因素与剪接因子表达式。在转录组不稳定相关分析,数据比较的随机排列可变剪接的分数和表达随机基因集。
作者:Bjarne Johannessen,安妮塔Sveen和罗尔夫。Skotheim
维护人员:Bjarne Johannessen < bjajoh在rr-research.no >
从内部引用(R,回车引用(“锡”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“锡”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“锡”)
| R脚本 | 介绍了锡包 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | AlternativeSplicing,DifferentialSplicing,ExonArray,GeneExpression,遗传学,微阵列,软件 |
| 版本 | 1.28.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.1 (r - 3.2)(7.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 2.12.0),data.table,嫁祸于,aroma.affymetrix |
| 进口 | WGCNA,南瓜,stringr |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,aroma.light,affxparser,RUnit,BiocGenerics |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | TIN_1.28.0.tar.gz |
| Windows二进制 | TIN_1.28.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | TIN_1.28.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TIN |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/锡 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/TIN/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
