TEQC

DOI:10.18129 / B9.bioc.TEQC

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅TEQC。

质量控制目标捕获实验

Bioconductor版本:3.15

目标捕获实验结合hybridization-based(在解决方案或微阵列)捕获感兴趣的和浓缩的基因组区域(如外显子组)的高通量测序DNA片段。这个包提供了评估和可视化功能的质量目标浓缩过程,捕获的特异性和敏感性,per-target读报道等等。

作者:m·胡默尔s Bonnin e·罗伊·g·罗马

维修工:莎拉Bonnin <萨拉。在crg.eu Bonnin >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“TEQC”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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PDF	R脚本	TEQC
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文本		新闻

细节

biocViews	遗传学,微阵列,质量控制,测序,软件
版本	4.18.0
Bioconductor自	BioC 2.8 (r - 2.13)(11.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	方法,BiocGenerics(> = 0.1.0),IRanges(> = 1.13.5),Rsamtools,hwriter
进口	Biobase(> = 2.15.1)
链接
建议
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增强了
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取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	TEQC_4.18.0.tar.gz
Windows二进制	TEQC_4.18.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	TEQC_4.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TEQC
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ TEQC
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/TEQC/
包下载报告	下载数据