光谱
DOI:10.18129 / B9.bioc.Spectra
这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅光谱。
光谱质谱数据的基础设施
Bioconductor版本:3.15
光谱包定义了一个有效的基础设施来存储和处理质谱光谱和功能子集,过程,可视化和比较光谱数据。它提供了不同的实现(后端)来存储质谱数据。这些包括后端调整了快速数据访问和处理和后端到非常大的数据集确保一个小内存占用。
作者:RforMassSpectrometry包维护者(cre)。劳伦与(aut)
,Johannes Rainer (aut)Sebastian吉布(aut)Jan Stanstrup(施)
维修工:RforMassSpectrometry包维护者<维护者rformassspectrometry.org >
从内部引用(R,回车引用(“光谱”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“光谱”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“光谱”)
| HTML | R脚本 | 描述和光谱的使用对象 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 基础设施,MassSpectrometry,代谢组学,蛋白质组学,软件 |
| 版本 | 1.6.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.12 (r - 4.0)(2年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 4.0.0),S4Vectors,BiocParallel,ProtGenerics(> = 1.25.1) |
| 进口 | 方法,IRanges,MsCoreUtils(> = 1.7.5)、图形、grDevices统计,工具,跑龙套,fs,BiocGenerics |
| 链接 | |
| 建议 | testthat,knitr(> = 1.1.0),msdata(> = 0.19.3),roxygen2,BiocStyle(> = 2.5.19),mzR(> = 2.19.6),rhdf5(> = 2.32.0),rmarkdown,vdiffr(> = 1.0.0) |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/RforMassSpectrometry/Spectra |
| BugReports | https://github.com/RforMassSpectrometry/Spectra/issues |
| 取决于我 | MsBackendMassbank,MsBackendMgf,MsBackendMsp,MsBackendRawFileReader |
| 进口我 | CompoundDb,MetaboAnnotation,MobilityTransformR |
| 建议我 | MetNet,PSMatch,xcms |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | Spectra_1.6.0.tar.gz |
| Windows二进制 | Spectra_1.6.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | Spectra_1.6.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Spectra |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/光谱 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Spectra/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
