SingleCellSignalR

DOI:10.18129 / B9.bioc.SingleCellSignalR

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SingleCellSignalR

细胞信号使用单细胞RNAseq数据分析

Bioconductor版本:3.15

允许单个细胞RNA seq数据分析,聚类,创建内部网络和推断信息交互。

作者:西蒙Cabello-Aguilar (aut),雅克Colinge (cre, aut)

维护人员:雅克Colinge <雅克。colinge在inserm.fr >

从内部引用(R,回车引用(“SingleCellSignalR”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“SingleCellSignalR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“SingleCellSignalR”)

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文本 新闻

细节

biocViews 分类,聚类,网络,RNASeq,SingleCell,软件
版本 1.8.0
Bioconductor自 BioC 3.11 (r - 4.0)(2.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (> = 4.0)
进口 BiocManager,circlize,limma,igraph,gplotsgrDevices,刨边机,SIMLR,data.table,pheatmap统计数据,Rtsne、图形、stringr,foreach,,食物,跑龙套
链接
建议 knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我 tidySingleCellExperiment
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 SingleCellSignalR_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 SingleCellSignalR_1.8.0.zip
macOS二进制(x86_64) SingleCellSignalR_1.8.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SingleCellSignalR
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SingleCellSignalR
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/SingleCellSignalR/
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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网