RnaSeqSampleSize

DOI:10.18129 / B9.bioc.RnaSeqSampleSize

这个包是Bioconductor的3.15版本。这个包已经从Bioconductor删除。最后稳定,最新的发布版本,请参阅RnaSeqSampleSize。

RnaSeqSampleSize

Bioconductor版本:3.15

RnaSeqSampleSize包提供了一个基于负二项模型样本容量的计算方法和准确的测试评估微分表达式RNA-seq数据的分析。它控制罗斯福为多个测试和利用读计数和平均色散分布从实际数据估计更可靠的样本大小。还配备了一些独特的功能,包括评估感兴趣的基因或途径,功率曲线的可视化和参数优化。

作者:石林赵开发者(aut (cre) Chung-I李(aut),郭岩(aut) Quanhu盛(aut),余Shyr (aut)

维修工:石林赵开发者< zhaoshilin gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“RnaSeqSampleSize”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“RnaSeqSampleSize”)

PDF	R脚本	RnaSeqSampleSize:样本量估计真实的数据
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,ExperimentalDesign,GeneExpression,ImmunoOncology,RNASeq,测序,软件
版本	2.6.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(7.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 4.0.0),ggplot2,RnaSeqSampleSizeData
进口	biomaRt,刨边机,heatmap3,matlab,KEGGREST、方法、grDevices图形,统计数据,Rcpp(> = 0.11.2),重新计票,ggpubr,SummarizedExperiment,tidyr,dplyr,tidyselect,跑龙套
链接	Rcpp
建议	BiocStyle,knitr,testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	RnaSeqSampleSize_2.6.0.tar.gz
Windows二进制	RnaSeqSampleSize_2.6.0.zip
macOS二进制(x86_64)	RnaSeqSampleSize_2.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RnaSeqSampleSize
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RnaSeqSampleSize
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RnaSeqSampleSize/
包下载报告	下载数据