RNAAgeCalc

DOI:10.18129 / B9.bioc.RNAAgeCalc

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅RNAAgeCalc。

multi-tissue转录年龄计算器

Bioconductor版本:3.15

它已经表明,DNA甲基化和RNA转录都与实足年龄和年龄相关的疾病。开发了几个估计预测人类衰老从DNA水平和RNA水平。大部分的人类转录年龄预测是基于微阵列数据和有限的只有少数组织。迄今为止,转录老龄研究使用RNASeq来自不同人体组织的数据是有限的。本方案的目的是提供一个工具across-tissue和组织转录年龄计算基于GTEx RNASeq数据。

作者:徐任(aut (cre),裴分矿(aut)

维护人员:徐任< xuren2120 gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“RNAAgeCalc”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“RNAAgeCalc”)

HTML	R脚本	RNAAgeCalc
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression,RNASeq,软件
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 3.11 (r - 4.0)(2.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.6)
进口	ggplot2,重新计票,嫁祸于,AnnotationDbi,org.Hs.eg.db统计数据,SummarizedExperiment、方法
链接
建议	knitr,rmarkdown,testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/reese3928/RNAAgeCalc
BugReports	https://github.com/reese3928/RNAAgeCalc/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	RNAAgeCalc_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	RNAAgeCalc_1.8.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	RNAAgeCalc_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RNAAgeCalc
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RNAAgeCalc
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RNAAgeCalc/
包下载报告	下载数据