日坛
DOI:10.18129 / B9.bioc.RITAN
这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅日坛。
术语注释和快速整合网络资源
Bioconductor版本:3.15
全面的基因集富集和提取工具multi-resource高信心子网。日坛促进生物信息学任务启用网络生物学研究。
作者:迈克尔·齐默尔曼(aut (cre)
维护人员:迈克尔-齐默尔曼说:< mtzimmermann mcw.edu >
从内部引用(R,回车引用(“日坛”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“日坛”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“日坛”)
| HTML | R脚本 | 选择资源 |
| HTML | R脚本 | 浓缩装饰图案 |
| HTML | R脚本 | Multi-Tissue分析 |
| HTML | R脚本 | 网络生物学装饰图案 |
| HTML | R脚本 | 资源之间的关系 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | FunctionalGenomics,GeneSetEnrichment,GraphAndNetwork,网络,NetworkEnrichment,NetworkInference,质量控制,软件 |
| 版本 | 1.20.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.5 (r - 3.4)(5.5年) |
| 许可证 | 文件许可证 |
| 取决于 | R (> = 4.0) |
| 进口 | 图形、方法、统计跑龙套、网格gridExtra,reshape2,gplots,ggplot2,plotrix,RColorBrewer,STRINGdb,制程,linkcomm,dynamicTreeCut,gsubfn,哈希,png,sqldf,igraph,BgeeDB,knitr,RITANdata,GenomicFeatures,ensembldb,AnnotationFilter,EnsDb.Hsapiens.v86 |
| 链接 | |
| 建议 | rmarkdown,BgeeDB |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | RITAN_1.20.0.tar.gz |
| Windows二进制 | RITAN_1.20.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | RITAN_1.20.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RITAN |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/日坛 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/RITAN/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
