RCM

DOI:10.18129 / B9.bioc.RCM

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅RCM。

适合row-column协会与微生物的负二项分布模型

Bioconductor版本:3.15

结合对数线性的想法列联表分析,灵活的响应函数估计和分散经验贝叶斯估计对探险的微生物组数据集的可视化。包包括无约束以及约束分析。此外,诊断检测可用缺乏合适的阴谋。

作者:Stijn Hawinkel (cre, aut)

维护人员:Stijn Hawinkel < Stijn。在psb.ugent.be hawinkel >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(RCM)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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HTML	R脚本	RCM pacakage手册
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文本		新闻

细节

biocViews	DimensionReduction,宏基因组,微生物组,软件,可视化
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 3.9 (r - 3.6)(3.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 4.0),DBI
进口	RColorBrewer,阿拉巴马州,刨边机,reshape2,tseries统计数据,VGAM,ggplot2(> = 2.2.1.9000),nleqslv,phyloseq,张量,质量grDevices、图形的方法
链接
建议	knitr,rmarkdown,testthat
SystemRequirements
增强了
URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/release/bioc/vignettes/RCM/inst/doc/RCMvignette.html/
BugReports	https://github.com/CenterForStatistics-UGent/RCM/issues
取决于我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	RCM_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	RCM_1.12.0.zip
macOS二进制(x86_64)	RCM_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RCM
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RCM
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RCM/
包下载报告	下载数据