PubScore

DOI:10.18129 / B9.bioc.PubScore

这个包是弃用。它可能会从Bioconductor删除。请参考包临终的指导方针为更多的信息。

这个包是Bioconductor的3.15版本。这个包已经从Bioconductor删除。最后稳定,最新的发布版本,请参阅PubScore。

自动计算文献相关性的基因

Bioconductor版本:3.15

计算分数的重要性对于一个给定的基因。重要性评分是总数量的文章在pubmed数据库结果基因和每学期的一个列表。

作者:蒂亚戈Lubiana (aut (cre)举行Nakaya (aut,黑色)

维护人员:蒂亚戈Lubiana < tiago.lubiana。阿尔维斯在usp.br >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“PubScore”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“PubScore”)

HTML	R脚本	FCBF:快速相关滤波器为基础特征选择
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	BiomedicalInformatics,表观遗传学,GeneExpression,GeneSetEnrichment,遗传学,SingleCell,软件,SystemsBiology,可视化
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 3.11 (r - 4.0)(2.5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 4.0.0)
进口	ggplot2,igraph,ggrepel,rentrez,进步、图形、dplyr、跑龙套、方法鹰图,网络,系统网络体系结构(sna)
链接
建议	FCBF,情节,SummarizedExperiment,SingleCellExperiment,knitr,rmarkdown,testthat(> =魅惑,BiocManager,biomaRt
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	PubScore_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	PubScore_1.8.0.zip
macOS二进制(x86_64)	PubScore_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PubScore
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ PubScore
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/PubScore/
包下载报告	下载数据