完美的

DOI:10.18129 / B9.bioc.PERFect

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅完美的。

排列为微生物数据过滤

Bioconductor版本:3.15

完美是一种新型的排列过滤方法旨在解决微生物数据处理两个有待解决的问题:(i)定义和量化损失过滤通过实现阈值,和(2)介绍和评估一个排列测试过滤损失提供一定程度的过度的过滤。

作者:Ekaterina Smirnova <叶。曹smirnova vcuhealth.org >, Quy < Quy。曹:umontana.edu >

维护人员:Quy曹< Quy。曹:umontana.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“完美”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“完美”)

HTML	R脚本	方法说明
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文本		新闻

细节

biocViews	分类,宏基因组,微生物组,测序,软件
版本	1.10.0
Bioconductor自	BioC 3.10 (r - 3.6)(3年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.6.0),sn(> = 1.5.2)
进口	ggplot2(> = 3.0.0),phyloseq(> = 1.28.0),动物园(> = 1.8.3),心理(> = 1.8.4),数据(> = 3.6.0),矩阵(> = 1.2.14),fitdistrplus(> = 1.0.12)、并行(> = 3.6.0)
链接
建议	knitr,rmarkdown,kableExtra,ggpubr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/cxquy91/PERFect
BugReports	https://github.com/cxquy91/PERFect/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	PERFect_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	PERFect_1.10.0.zip
macOS二进制(x86_64)	PERFect_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PERFect
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/完美的
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/PERFect/
包下载报告	下载数据