Oscope

DOI:10.18129 / B9.bioc.Oscope

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅Oscope

Oscope——统计管道识别振荡在同步的单细胞RNA-seq基因

Bioconductor版本:3.15

Oscope是统计管道开发识别和恢复基本周期的振荡基因在非同步单细胞RNA-seq实验。Oscope管道包括三个模块:一个正弦模型模块搜索候选人振荡器对;K-medoids集群模块集群候选人振荡器组;和一个扩展的插入模块恢复基本周期为每个振荡器组。

作者:宁愣了

维护人员:宁愣了< lengning1 gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“Oscope”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“Oscope”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

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browseVignettes (“Oscope”)

PDF R脚本 Oscope_vigette
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GeneExpression,ImmunoOncology,RNASeq,测序,软件,StatisticalMethod
版本 1.26.0
Bioconductor自 BioC 3.2 (r - 3.2)(7年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 EBSeq,集群,testthat,BiocParallel
进口
链接
建议 BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 Oscope_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 Oscope_1.26.0.zip
macOS二进制(x86_64) Oscope_1.26.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Oscope
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ Oscope
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/Oscope/
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