MsBackendRawFileReader

DOI:10.18129 / B9.bioc.MsBackendRawFileReader

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MsBackendRawFileReader。

质谱分析后端阅读热费希尔科学原始文件

Bioconductor版本:3.15

实现了光谱的MsBackend包使用热费希尔科学NewRawFileReader。net库。包是概括介绍的功能rawrr包(Kockmann t . et al。(2020) 这个包中定义的)方法应该扩展光谱Bioconductor包。

作者:基督教Panse (aut (cre),托拜厄斯Kockmann (aut)

维护人员:基督教Panse < cp在fgcz.ethz.ch >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MsBackendRawFileReader”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“MsBackendRawFileReader”)

HTML	R脚本	使用和扩展MsBackendRawFileReader的后端。
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文本		安装

细节

biocViews	MassSpectrometry,代谢组学,蛋白质组学,软件
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.14 (r - 4.1)(1年)
许可证	GPL-3
取决于	R(> = 4.1),方法,光谱(> = 1.5.8)
进口	MsCoreUtils,S4Vectors,IRanges,rawrr(> = 1.3.6),跑龙套,BiocParallel
链接
建议	BiocStyle(> = 2.5),ExperimentHub,MsBackendMgf,knitr,晶格,mzR,protViz(> = 0.7),rmarkdown,鞑靼(> = 1.5),testthat
SystemRequirements	mono-runtime 4。x或更高版本(包括系统。数据库)在Linux / macOS、。net框架(> = 4.5.1)在使用微软的Windows操作系统。
增强了
URL	https://github.com/fgcz/MsBackendRawFileReader
BugReports	https://github.com/fgcz/MsBackendRawFileReader/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	MsBackendRawFileReader_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	MsBackendRawFileReader_1.2.0.zip
macOS二进制(x86_64)	MsBackendRawFileReader_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MsBackendRawFileReader
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MsBackendRawFileReader
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MsBackendRawFileReader/
包下载报告	下载数据