MsBackendMgf

DOI:10.18129 / B9.bioc.MsBackendMgf

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MsBackendMgf。

质谱数据的后端吉祥物通用格式(mgf)文件

Bioconductor版本:3.15

质谱(MS)数据后端支持进出口MS / MS谱数据从吉祥物通用格式(mgf)文件。这个包中定义的对象应该是使用光谱Bioconductor包。这个包因此mgf文件支持光谱包补充道。

作者:RforMassSpectrometry包维护者(cre)。劳伦与(aut),Johannes Rainer (aut)Sebastian吉布(aut)

维修工:RforMassSpectrometry包维护者<维护者rformassspectrometry.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MsBackendMgf”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“MsBackendMgf”)

HTML	R脚本	MsBackendMgf的描述和用法
PDF		参考手册

细节

biocViews	DataImport,基础设施,MassSpectrometry,代谢组学,蛋白质组学,软件
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 3.13 (r - 4.1)(1.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.0),光谱(> = 1.5.14)
进口	BiocParallel,S4Vectors,IRanges,MsCoreUtils、方法、统计数据
链接
建议	testthat,knitr(> = 1.1.0),roxygen2,BiocStyle(> = 2.5.19),rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/RforMassSpectrometry/MsBackendMgf
BugReports	https://github.com/RforMassSpectrometry/MsBackendMgf/issues
取决于我
进口我
建议我	MsBackendRawFileReader,xcms
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	MsBackendMgf_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	MsBackendMgf_1.4.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	MsBackendMgf_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MsBackendMgf
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MsBackendMgf
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MsBackendMgf/
包下载报告	下载数据