MBECS

DOI:10.18129 / B9.bioc.MBECS

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MBECS。

批处理效果的评价和修正微生物数据集

Bioconductor版本:3.15

微生物组批效应校正套件(MBECS)提供了一组功能评估和减轻这么噪声由于成批处理。最后它把主机批处理纠正算法(贝科)从不同的包。此外,它提供了一个修正和报告管道提供初步看气候资料校正前后的特征为批处理效果。

作者:迈克尔Olbrich (aut (cre)

维护人员:迈克尔Olbrich < M。在protonmail.com Olbrich >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MBECS”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes (“MBECS”)

HTML	R脚本	MBECS介绍
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	BatchEffect,微生物组,归一化,质量控制,ReportWriting,软件,可视化
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.15 (r - 4.2)(0.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.1)
进口	方法,magrittr,phyloseq,limma,lme4,lmerTest,pheatmap,rmarkdown,集群,dplyr,ggplot2,gridExtra,ruv,股东价值分析,宠物猫,tidyr,素食主义者,统计,跑龙套,矩阵
链接
建议	knitr,减价,BiocStyle,testthat(> = 3.0.0)
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/rmolbrich/MBECS
BugReports	https://github.com/rmolbrich/MBECS/issues/new
取决于我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	MBECS_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	MBECS_1.0.0.zip
macOS二进制(x86_64)	MBECS_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MBECS
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MBECS
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MBECS/
包下载报告	下载数据