KEGGlincs

DOI:10.18129 / B9.bioc.KEGGlincs

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅KEGGlincs

想象中的所有边缘KEGG通路和覆盖距离数据

Bioconductor版本:3.15

看看是怎么回事的引擎盖下面KEGG通路通过显式地重建信息从KGML获得文件的路径映射。

作者:Shana白

维护者:马里奥Medvedovic Shana白< vandersm mail.uc.edu >, < medvedm ucmail.uc.edu >

从内部引用(R,回车引用(“KEGGlincs”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“KEGGlincs”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“KEGGlincs”)

HTML R脚本 KEGGlincs工作流
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文本 新闻

细节

biocViews CellBiology,DataRepresentation,GeneExpression,GraphAndNetwork,KEGG,网络,NetworkInference,通路,软件,ThirdPartyClient
版本 1.22.0
Bioconductor自 BioC 3.4 (r - 3.3)(6年)
许可证 GPL-3
取决于 R (> = 3.3),KOdata,hgu133a.db,org.Hs.eg.db(> = 3.3.0)
进口 AnnotationDbi,KEGGgraph,igraph,plyr,gtools,httr,RJSONIO,KEGGREST、方法、图形数据,跑龙套,XML,grDevices
链接
建议 BiocManager(> = 1.20.3),knitr,
SystemRequirements Cytoscape (> = 3.3.0), Java (> = 8)
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 KEGGlincs_1.22.0.tar.gz
Windows二进制 KEGGlincs_1.22.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64) KEGGlincs_1.22.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/KEGGlincs
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ KEGGlincs
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/KEGGlincs/
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  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网