检查

DOI:10.18129 / B9.bioc.INSPEcT

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅检查

建模RNA合成,与RNA-seq数据处理和退化

Bioconductor版本:3.15

检查(推理合成、加工、降解率从转录组数据)在时间进程RNA-seq数据实验或稳态条件,有或没有新生的RNA的支持数据。

作者:斯特凡诺德Pretis

维护人员:斯特凡诺德Pretis < ste.depo gmail.com >, Mattia可•福尔兰正< Mattia。可•福尔兰正在iit.it >

从内部引用(R,回车引用(“检查”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“检查”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“检查”)

HTML R脚本 检查——推理合成,从转录组数据处理和降解率
HTML R脚本 INSPEcT_GUI.html
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GeneRegulation,RNASeq,测序,软件,SystemsBiology,TimeCourse
版本 1.26.0
Bioconductor自 BioC 3.2 (r - 3.2)(7年)
许可证 GPL-2
取决于 R(> = 3.6),方法,Biobase,BiocParallel
进口 pROC,deSolve,rootSolve,KernSmooth,gdata,GenomicFeatures,GenomicRanges,IRanges,BiocGenerics,GenomicAlignments,Rsamtools,S4Vectors,GenomeInfoDb,DESeq2,plgem,rtracklayer,SummarizedExperiment,TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene,闪亮的
链接
建议 BiocStyle,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 INSPEcT_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 INSPEcT_1.26.0.zip
macOS二进制(x86_64) INSPEcT_1.26.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/INSPEcT
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/检查
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/INSPEcT/
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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网