检查
DOI:10.18129 / B9.bioc.INSPEcT
这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅检查。
建模RNA合成,与RNA-seq数据处理和退化
Bioconductor版本:3.15
检查(推理合成、加工、降解率从转录组数据)在时间进程RNA-seq数据实验或稳态条件,有或没有新生的RNA的支持数据。
作者:斯特凡诺德Pretis
维护人员:斯特凡诺德Pretis < ste.depo gmail.com >, Mattia可•福尔兰正< Mattia。可•福尔兰正在iit.it >
从内部引用(R,回车引用(“检查”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“检查”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“检查”)
| HTML | R脚本 | 检查——推理合成,从转录组数据处理和降解率 |
| HTML | R脚本 | INSPEcT_GUI.html |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | GeneRegulation,RNASeq,测序,软件,SystemsBiology,TimeCourse |
| 版本 | 1.26.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.2 (r - 3.2)(7年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R(> = 3.6),方法,Biobase,BiocParallel |
| 进口 | pROC,deSolve,rootSolve,KernSmooth,gdata,GenomicFeatures,GenomicRanges,IRanges,BiocGenerics,GenomicAlignments,Rsamtools,S4Vectors,GenomeInfoDb,DESeq2,plgem,rtracklayer,SummarizedExperiment,TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene,闪亮的 |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | INSPEcT_1.26.0.tar.gz |
| Windows二进制 | INSPEcT_1.26.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | INSPEcT_1.26.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/INSPEcT |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/检查 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/INSPEcT/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
