GA4GHshiny

DOI:10.18129 / B9.bioc.GA4GHshiny

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GA4GHshiny

闪亮的申请与GA4GH-based数据服务器交互

Bioconductor版本:3.15

GA4GHshiny包提供了一种简便的方法与数据服务器进行交互基于基因组学和全球联盟健康(GA4GH)基因组学API通过一个闪亮的应用程序。它还集成了信标网络。

作者:Welliton Souza (aut (cre) Benilton卡瓦略(施),克莉斯婷罗查[所有],伊丽莎白Borgognoni(施)

维护人员:Welliton Souza < well309 gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“GA4GHshiny”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“GA4GHshiny”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“GA4GHshiny”)

HTML R脚本 GA4GHshiny
PDF 参考手册

细节

biocViews GUI,软件
版本 1.18.0
Bioconductor自 BioC 3.6 (r - 3.4)(5年)
许可证 GPL-3
取决于 GA4GHclient
进口 AnnotationDbi,BiocGenerics,dplyr,DT,GenomeInfoDb,openxlsx,GenomicFeatures、方法、purrr,S4Vectors,闪亮的,shinyjs,tidyr,shinythemes
链接
建议 BiocStyle,org.Hs.eg.db,knitr,rmarkdown,testthat,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/labbcb/GA4GHshiny
BugReports https://github.com/labbcb/GA4GHshiny/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 GA4GHshiny_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 GA4GHshiny_1.18.0.zip
macOS二进制(x86_64) GA4GHshiny_1.18.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GA4GHshiny
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GA4GHshiny
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GA4GHshiny/
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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网