EBSeqHMM

DOI:10.18129 / B9.bioc.EBSeqHMM

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅EBSeqHMM。

贝叶斯分析识别基因或同种型表达的变化要求RNA-seq实验

Bioconductor版本:3.15

EBSeqHMM包实现了隐马尔可夫模型自回归的统计分析命令RNA-seq实验(如时间或空间课程数据)。EBSeqHMM包提供函数来识别基因和亚型不恒定表达谱时间点/职位,和集群成路径表达式。

作者:宁愣,克里斯蒂娜Kendziorski

维护人员:宁愣了< lengning1 gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“EBSeqHMM”)

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文档

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文本		新闻

细节

biocViews	贝叶斯,DifferentialExpression,GeneExpression,HiddenMarkovModel,ImmunoOncology,MultipleComparison,RNASeq,测序,软件,StatisticalMethod,TimeCourse
版本	1.30.0
Bioconductor自	BioC 3.0 (r - 3.1)(8年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	EBSeq
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	EBSeqHMM_1.30.0.tar.gz
Windows二进制	EBSeqHMM_1.30.0.zip
macOS二进制(x86_64)	EBSeqHMM_1.30.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/EBSeqHMM
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ EBSeqHMM
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/EBSeqHMM/
包下载报告	下载数据