EBSeq

DOI:10.18129 / B9.bioc.EBSeq

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅EBSeq。

R包基因和同种型微分表达式RNA-seq数据的分析

Bioconductor版本:3.15

微分表达式分析基因和同种型水平使用RNA-seq数据

作者:宁愣,克里斯蒂娜Kendziorski

维护人员:宁愣了< lengning1 gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“EBSeq”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“EBSeq”)

PDF	R脚本	EBSeq装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,ImmunoOncology,MultipleComparison,RNASeq,测序,软件,StatisticalMethod
版本	1.36.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(9年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	blockmodeling,gplots,testthatR (> = 3.0.0)
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	EBSeqHMM,Oscope
进口我	DEsubs,scDD
建议我	compcodeR
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	EBSeq_1.36.0.tar.gz
Windows二进制	EBSeq_1.36.0.zip
macOS二进制(x86_64)	EBSeq_1.36.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/EBSeq
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ EBSeq
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/EBSeq/
包下载报告	下载数据