EBSEA

DOI:10.18129 / B9.bioc.EBSEA

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅EBSEA。

基于外显子基因表达分析的策略

Bioconductor版本:3.15

计算基于外显子基因的差异表达基因的数量从RNA-seq测序获得的数据。

作者:阿尔发Mehmood起来Laiho,劳拉·l·值得信赖

维护人员:阿尔发Mehmood <阿尔发。mehmood在utu.fi >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“EBSEA”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“EBSEA”)

HTML	R脚本	EBSEA
PDF		参考手册

细节

biocViews	DifferentialExpression,GeneExpression,测序,软件
版本	1.24.0
Bioconductor自	BioC 3.3 (r - 3.3)(6.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 4.0.0)
进口	DESeq2、图表、数据、EmpiricalBrownsMethod
链接
建议	knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	EBSEA_1.24.0.tar.gz
Windows二进制	EBSEA_1.24.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	EBSEA_1.24.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/EBSEA
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ EBSEA
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/EBSEA/
包下载报告	下载数据