DirichletMultinomial

DOI:10.18129 / B9.bioc.DirichletMultinomial

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅DirichletMultinomial。

Dirichlet-Multinomial混合微生物组数据的机器学习模型

Bioconductor版本:3.15

Dirichlet-multinomial混合模型可以用来描述可变性在微生物宏基因组数据。这个包是一个最初由福尔摩斯可用接口代码,哈里斯和海棠,2012年,《公共科学图书馆•综合》7(2):1 - 15,作为这个包的手册页中进行进一步的讨论,? DirichletMultinomial。

作者:马丁·摩根<马丁。摩根在roswellpark.org >

维修工:马丁·摩根<马丁。摩根在roswellpark.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“DirichletMultinomial”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“DirichletMultinomial”)

PDF	R脚本	介绍DirichletMultinomial
PDF		参考手册

细节

biocViews	分类,聚类,ImmunoOncology,宏基因组,微生物组,测序,软件
版本	1.38.0
Bioconductor自	BioC 2.11 (r - 2.15)(10年)
许可证	LGPL-3
取决于	S4Vectors,IRanges
进口	stats4、方法BiocGenerics
链接
建议	晶格平行,质量,RColorBrewer,xtable
SystemRequirements	gsl
增强了
URL
取决于我
进口我	米娅,miaViz,TFBSTools
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	DirichletMultinomial_1.38.0.tar.gz
Windows二进制	DirichletMultinomial_1.38.0.zip
macOS二进制(x86_64)	DirichletMultinomial_1.38.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DirichletMultinomial
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DirichletMultinomial
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DirichletMultinomial/
包下载报告	下载数据