这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅DAPAR。
Bioconductor版本:3.15
的包DAPAR Bioconductor分布式R包提供了所有必要的功能来分析定量数据从label-free蛋白质组学实验。相反大多数其他类似R包,它是丰富的和用户友好的图形界面,所以不需要编程技巧(见“Prostar”包)。
作者:塞缪尔Wieczorek (aut (cre),佛罗伦萨梳(aut),托马斯•汉堡(aut) Vasile-Cosmin Lazar[所有],Enora Fremy[所有],海琳博尔赫斯(施)
维护人员:塞缪尔Wieczorek <撒母耳。wieczorek在cea.fr >
从内部引用(R,回车引用(“DAPAR”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“DAPAR”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“DAPAR”)
R脚本 | Prostar用户手册 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataImport,去,MassSpectrometry,归一化,预处理,蛋白质组学,质量控制,软件 |
版本 | 1.28.5 |
Bioconductor自 | BioC 3.2 (r - 3.2)(7年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 4.2.0) |
进口 | Biobase,MSnbase,DAPARdata(> = 1.26.3),跑龙套,highcharter,foreach |
链接 | |
建议 | testthat,BiocStyle,AnnotationDbi,clusterProfiler,图,diptest,集群,vioplot,visNetwork,vsn,igraph,FactoMineR,factoextra,dendextend平行,doParallel,Mfuzz,apcluster,forcats,readxl,openxlsx,multcomp,purrr,宠物猫,knitr,规范,尺度,tidyverse,cp4p,imp4p(> = 1.1),lme4,dplyr,limma,preprocessCore,stringr,tidyr,嫁祸于,gplotsgrDevices,reshape2、图形、数据、方法、ggplot2,RColorBrewer,矩阵,org.Sc.sgd.db |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://www.prostar-proteomics.org/ |
BugReports | https://github.com/prostarproteomics/DAPAR/issues |
取决于我 | |
进口我 | Prostar |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | DAPAR_1.28.5.tar.gz |
Windows二进制 | DAPAR_1.28.5.zip |
macOS二进制(x86_64) | DAPAR_1.28.5.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DAPAR |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DAPAR |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/DAPAR/ |
包下载报告 | 下载数据 |