CytoGLMM

DOI:10.18129 / B9.bioc.CytoGLMM

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅CytoGLMM。

有条件的微分分析质量流和血细胞计数实验

Bioconductor版本:3.15

CytoGLMM R包实现了两个多元回归策略:一个引导广义线性模型(GLM)和广义线性混合模型(GLMM)。最新的数据分析工具比较表达式在许多计算发现细胞类型。CytoGLMM关注的只是一个细胞类型。窄的领域的应用程序允许我们定义一个更具体的统计模型和容易控制统计担保。结果,CytoGLMM发现差异蛋白和大规模血细胞计数数据流同时减少偏见引起的标志引起的相关性和维护错误的发现病人的异质性。

作者:Christof西勒(aut (cre)

维护人员:Christof西勒<创造者。西勒在maastrichtuniversity.nl >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“CytoGLMM”)

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文档

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HTML	R脚本	CytoGLMM工作流
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细节

biocViews	CellBasedAssays,CellBiology,FlowCytometry,ImmunoOncology,蛋白质组学,回归,SingleCell,软件,StatisticalMethod
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 3.13 (r - 4.1)(1.5年)
许可证	LGPL-3
取决于
进口	统计数据、方法BiocParallel,RColorBrewer,cowplot,doParallel,dplyr,factoextra,flexmix,ggplot2,magrittr,mb,pheatmap,speedglm,stringr,strucchange,宠物猫,ggrepel,质量,日志记录,矩阵,tidyr,脱字符号,rlang,grDevices
链接
建议	knitr,rmarkdown,testthat,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	https://christofseiler.github.io/CytoGLMMhttps://github.com/ChristofSeiler/CytoGLMM
BugReports	https://github.com/ChristofSeiler/CytoGLMM/issues
取决于我
进口我	CyTOFpower
建议我
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	CytoGLMM_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	CytoGLMM_1.4.0.zip
macOS二进制(x86_64)	CytoGLMM_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CytoGLMM
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CytoGLMM
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CytoGLMM/
包下载报告	下载数据