CellNOptR

DOI:10.18129 / B9.bioc.CellNOptR

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅CellNOptR。

培训使用先验知识网络的信号网络的布尔逻辑模型和扰动数据

Bioconductor版本:3.15

这个包做优化的布尔逻辑网络基于先前的知识网络的信号通路和一组数据在网络中的节点的扰动。

作者:托马斯Cokelaer (aut) Federica Eduati (aut),艾丹业务(aut)年代Schrier[所有],卡米尔Terfve (aut) Enio Gjerga[所有],阿提拉伽柏(cre)

维护人员:<匈奴王阿提拉伽柏。伽柏在uni-heidelberg.de >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“CellNOptR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes (“CellNOptR”)

HTML	R脚本	布尔逻辑模型的训练信号网络的使用与CellNOptR先验知识网络和扰动数据
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CellBasedAssays,CellBiology,ImmunoOncology,网络,通路,蛋白质组学,软件,TimeCourse
版本	1.42.1
Bioconductor自	BioC 2.9 (r - 2.14)(11年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.0.0),RBGL,图、方法、RCurl,Rgraphviz,XML,ggplot2,rmarkdown
进口	igraph,stringi,stringr
链接
建议	data.table,dplyr,tidyr,readr,knitr,RUnit,BiocGenerics
SystemRequirements	Graphviz版本> = 2.2
增强了	doParallel,foreach
URL
取决于我	CNORdt,CNORfeeder,CNORfuzzy,CNORode
进口我	bnem
建议我	MEIGOR
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	CellNOptR_1.42.1.tar.gz
Windows二进制	CellNOptR_1.42.1.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	CellNOptR_1.42.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CellNOptR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CellNOptR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CellNOptR/
包下载报告	下载数据