这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅CancerSubtypes。
Bioconductor版本:3.15
CancerSubtypes集成了目前常见的计算生物学方法对癌症亚型识别和提供了一个标准化的框架对癌症亚型分析multi-omics数据,如基因表达,microrna的表达、DNA甲基化等。
作者:Taosheng徐(aut (cre)
维护人员:徐Taosheng < Taosheng。在gmail.com x >
从内部引用(R,回车引用(“CancerSubtypes”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“CancerSubtypes”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“CancerSubtypes”)
HTML | R脚本 | CancerSubtypes |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 聚类,GeneExpression,软件,可视化 |
版本 | 1.22.1 |
Bioconductor自 | BioC 3.4 (r - 3.3)(6年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R (> = 4.0),sigclust,NMF |
进口 | 集群,嫁祸于,limma,ConsensusClusterPlusgrDevices,生存 |
链接 | |
建议 | BiocGenerics,knitr,RTCGA.mRNA,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/taoshengxu/CancerSubtypes |
BugReports | https://github.com/taoshengxu/CancerSubtypes/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | CancerSubtypes_1.22.1.tar.gz |
Windows二进制 | CancerSubtypes_1.22.1.zip |
macOS二进制(x86_64) | CancerSubtypes_1.22.1.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CancerSubtypes |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CancerSubtypes |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/CancerSubtypes/ |
包下载报告 | 下载数据 |