相机
DOI:10.18129 / B9.bioc.CAMERA
这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅相机。
质谱数据的收集相关的注释方法
Bioconductor版本:3.15
注释的peaklists由xcms生成,基于规则的同位素的注释和加合物,同位素验证、基于启德集团相关的标记未知的加合物和碎片
作者:Carsten库尔,拉尔夫Tautenhahn亨德里克•Treutler,史蒂芬诺伊曼{ckuhl | htreutle | sneumann} @ipb-halle.de, rtautenh@scripps.edu
维修工:史蒂芬诺伊曼< sneumann在ipb-halle.de >
从内部引用(R,回车引用(“相机”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“相机”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“相机”)
| 原子数与compoundQuantiles预期 | ||
| 用摄影机同位素模式验证 | ||
| R脚本 | 分子识别与相机 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | ImmunoOncology,MassSpectrometry,代谢组学,软件 |
| 版本 | 1.52.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.4 (r - 2.9)(13.5年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R(> = 3.5.0)、方法Biobase,xcms(> = 1.13.5) |
| 进口 | 方法,xcms,RBGL,图、图形、grDevices统计,跑龙套,Hmisc,igraph |
| 链接 | |
| 建议 | faahKO,RUnit,BiocGenerics |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | Rmpi,雪 |
| URL | http://msbi.ipb-halle.de/msbi/CAMERA/ |
| BugReports | https://github.com/sneumann/CAMERA/issues/new |
| 取决于我 | flagme,首次公开募股,LOBSTAHS,MAIT,metaMS,PtH2O2lipids |
| 进口我 | |
| 建议我 | cliqueMS,msPurity,mtbls2,RMassBank |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | CAMERA_1.52.0.tar.gz |
| Windows二进制 | CAMERA_1.52.0.zip(64位) |
| macOS二进制(x86_64) | CAMERA_1.52.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CAMERA |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/相机 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/CAMERA/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
