这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅BrainSABER。
Bioconductor版本:3.15
艾伦脑科学研究所提供了一种RNA序列(RNA-Seq)数据资源为研究人类大脑发育的转录机制称为BrainSpan。BrainSABER R是一个包,促进了用户数据的比较中发现的各种发展阶段和大脑结构生成动态相似性的热图BrainSpan阿特拉斯的两个数据集。它还提供了一个自我用户数据的容器。
作者:嘉莉云煌岩(aut),普Radichev (aut),生物医学工程(aut (cre)美元
维修工:生物医学工程美元< bicbioeng gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“BrainSABER”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“BrainSABER”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“BrainSABER”)
HTML | R脚本 | BrainSABER |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | GeneExpression,测序,软件,可视化 |
版本 | 1.6.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.12 (r - 4.0)(2年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 4.1.0),biomaRt,SummarizedExperiment |
进口 | data.table,文理学院、方法、S4Vectors跑龙套,BiocFileCache,闪亮的 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,ComplexHeatmap,fastcluster,的热图,knitr,情节,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | BrainSABER_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | BrainSABER_1.6.0.zip |
macOS二进制(x86_64) | BrainSABER_1.6.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BrainSABER |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BrainSABER |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/BrainSABER/ |
包下载报告 | 下载数据 |