BaseSpaceR

DOI:10.18129 / B9.bioc.BaseSpaceR

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅BaseSpaceR。

R SDK BaseSpace RESTful API

Bioconductor版本:3.15

富R界面Illumina公司BaseSpace的云计算环境中,使快速发展的数据分析和可视化工具。

作者:阿德里安Alexa

维修工:杰瑞德·奥康奈尔< joconnell illumina.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“BaseSpaceR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“BaseSpaceR”)

PDF	R脚本	BaseSpaceR
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ConnectTools,DataImport,DataRepresentation,遗传学,HighThroughputSequencing,基础设施,测序,软件
版本	1.40.0
Bioconductor自	BioC 2.12 (r - 3.0)(9.5年)
许可证	Apache 2.0许可
取决于	R (> = 2.15.0),RCurl,RJSONIO
进口	方法
链接
建议	RUnit,IRanges,Rsamtools
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	BaseSpaceR_1.40.0.tar.gz
Windows二进制	BaseSpaceR_1.40.0.zip
macOS二进制(x86_64)	BaseSpaceR_1.40.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BaseSpaceR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BaseSpaceR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BaseSpaceR/
包下载报告	下载数据