ArrayExpress

DOI:10.18129 / B9.bioc.ArrayExpress

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ArrayExpress。

访问ArrayExpress微阵列数据库在EBI和构建Bioconductor数据结构:ExpressionSet, AffyBatch NChannelSet

Bioconductor版本:3.15

访问在EBI和构建Bioconductor ArrayExpress库数据结构:ExpressionSet, AffyBatch NChannelSet

作者:奥黛丽•考夫曼易卜拉欣伊玛目,迈克尔·舒伯特

维护人员:哈姆·穆罕默德在ebi.ac.uk > <哈姆

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ArrayExpress”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“ArrayExpress”)

PDF	R脚本	ArrayExpress:导入和R ArrayExpress数据集转换成对象
PDF		参考手册

细节

biocViews	DataImport,微阵列,OneChannel,软件,TwoChannel
版本	1.56.0
Bioconductor自	BioC 2.3 (r - 2.8)(14年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 2.9.0),Biobase(> =测试盒框)
进口	XML,益生元,limma
链接
建议	affy
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	DrugVsDisease,maEndToEnd
进口我	寻的器
建议我	Hiiragi2013
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	ArrayExpress_1.56.0.tar.gz
Windows二进制	ArrayExpress_1.56.0.zip
macOS二进制(x86_64)	ArrayExpress_1.56.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ArrayExpress
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ArrayExpress
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ArrayExpress/
包下载报告	下载数据