这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅AnnotationFilter。
Bioconductor版本:3.15
这个包提供了类和其他基础设施实现过滤器操纵Bioconductor注释资源。过滤器将被用于ensembldb,有机体。dplyr和其他包。
作者:马丁•摩根(aut)约翰Rainer (aut),约阿希姆Bargsten[所有],丹尼尔·Twisk[所有],Bioconductor包维护者(cre)
维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >
从内部引用(R,回车引用(“AnnotationFilter”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“AnnotationFilter”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“AnnotationFilter”)
HTML | R脚本 | 过滤设施Bioconductor注释资源 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 注释,基础设施,软件 |
版本 | 1.20.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.5 (r - 3.4)(5.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 3.4.0) |
进口 | 跑龙套、方法GenomicRanges,lazyeval |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,testthat,RSQLite,org.Hs.eg.db,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/Bioconductor/AnnotationFilter |
BugReports | https://github.com/Bioconductor/AnnotationFilter/issues |
取决于我 | chimeraviz,CompoundDb,ensembldb,Organism.dplyr |
进口我 | biovizBase,BUSpaRse,drugTargetInteractions,GenomicDistributionsData,ggbio,QFeatures,日坛,scanMiRApp,TVTB |
建议我 | dasper,GenomicDistributions,GenomicFeatures,TFutils,wiggleplotr |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | AnnotationFilter_1.20.0.tar.gz |
Windows二进制 | AnnotationFilter_1.20.0.zip |
macOS二进制(x86_64) | AnnotationFilter_1.20.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AnnotationFilter |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ AnnotationFilter |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/AnnotationFilter/ |
包下载报告 | 下载数据 |