王牌
DOI:10.18129 / B9.bioc.ACE
这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅王牌。
绝对从信号低拷贝数估计全基因组测序
Bioconductor版本:3.15
使用分段拷贝数的数据来估计肿瘤细胞百分比和生产拷贝数块显示绝对数字副本。
作者:Poell乔斯B
维护人员:乔斯B Poell < j。在amsterdamumc.nl poell >
从内部引用(R,回车引用(“王牌”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“王牌”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“王牌”)
| HTML | R脚本 | ACE装饰图案 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | CopyNumberVariation,报道,DNASeq,测序,软件,可视化,WholeGenome |
| 版本 | 1.14.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.8 (r - 3.5)(4年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (> = 3.4) |
| 进口 | Biobase,QDNAseq,ggplot2、网格数据,跑龙套、方法grDevices,GenomicRanges |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,rmarkdown,BiocStyle |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/tgac-vumc/ACE |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | ACE_1.14.0.tar.gz |
| Windows二进制 | ACE_1.14.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | ACE_1.14.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ACE |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/王牌 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ACE/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
