pwmenrich
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doi：10.18129/b9.bioc.pwmenrich
PWM富集分析
生物导体版本：版本（3.15）
用于DNA基序扫描和富集分析的高级功能的工具包。主要功能是对已知的PWM的PWM富集分析（例如，来自数据库，例如iTobifDB），但该软件包还实现了用于PWM扫描和可视化的高级功能。该软件包不会执行“从头”主题发现，而是专注于使用实验得出或由其他工具构建的计算的主题。
作者：Robert Stojnic，Diego Diez
维护者：迭戈·迪兹（Diego Diez）
引用（从r内，输入引用（“ Pwmenrich”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ pwmenrich”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Pwmenrich”）
| R脚本 | “ PWMENRICH”软件包的概述 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 图案，，，，测序，，，，软件 |
| 版本 | 4.32.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.11（R-2.15）（10年） |
| 执照 | LGPL（> = 2） |
| 要看 | r（> = 3.5.0），方法，生物基因，，，，生物弦 |
| 进口 | 网格，seqlogo，，，，gdata，，，，evd，，，，S4VECTORS |
| 链接 | |
| 建议 | 主题，，，，BSGENOME，，，，bsgenome.dmelanogaster.ucsc.dm3，，，，pwmenrich.dmelanogaster.background，，，，测试，，，，gtools， 平行，pwmenrich.hsapiens.background，，，，pwmenrich.mmusculus.background，，，，生物使用，，，，尼特 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | pwmenrich.dmelanogaster.background，，，，pwmenrich.hsapiens.background，，，，pwmenrich.mmusculus.background |
| 进口我 | |
| 建议我 | rtrm |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | pwmenrich_4.32.0.tar.gz |
| Windows二进制 | pwmenrich_4.32.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | pwmenrich_4.32.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pwmenrich |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/pwmenrich |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/pwmenrich/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
