tcgaWGBSData.hg19

DOI:10.18129 / B9.bioc.tcgaWGBSData.hg19

这个包裹是弃用．它可能会从Bioconductor中移除。详情请参阅包装寿命终止指南获取更多信息。

此包适用于Bioconductor 3.14版。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定发布版本，请参见tcgaWGBSData.hg19．

数据

Bioconductor版本:3.14

TCGA中WGBS数据的数据包。数据以“总结实验格式”存储。关于如何提取数据和执行差异甲基化分析，请参阅小插图。

作者:Divy Kangeyan

维护者:Divy Kangeyan

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("tcgaWGBSData.hg19")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“tcgaWGBSData.hg19”)

超文本标记语言	R脚本	装饰图案的标题
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CancerData，ExperimentData，基因组，Homo_sapiens_Data，SequencingData
版本	1.12.0
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.5.0)，ExperimentHub
进口	bsseq，knitr
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/aryeelab/tcgaWGBSData.hg19/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	tcgaWGBSData.hg19_1.12.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tcgaWGBSData.hg19
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/tcgaWGBSData.hg19
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/tcgaWGBSData.hg19/
软件包下载报告	下载数据