裂变
DOI:10.18129 / B9.bioc.fission
此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见裂变．
裂变酵母对应激反应的时间过程RNA-Seq实验，由Leong等人，Nat Commun 2014。
Bioconductor版本:3.14
该软件包提供了一个范围总结实验对象，用于裂变酵母(Schizosaccharomyces pombe)在氧化应激(1M山梨醇处理)下0,15,30,60,120和180分钟的时间过程RNA-Seq实验中的基因reads计数。样本进一步分为野生型组和atf21缺失组。读计数矩阵由研究作者Leong HS, Dawson K, Wirth C, Li Y, Connolly Y, Smith DL, Wilkinson CR, Miller CJ准备和提供。“一个全球性的非编码RNA系统调节裂变酵母蛋白水平以应对压力”。Nat Commun 2014年5月23日;5:3947。PMID: 24853205。地理:GSE56761。
作者:迈克尔·洛夫
维护者:Michael Love
引文(从R内，输入引用(“裂变”))：
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“裂变”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 裂变酵母时间历程 |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | ExperimentData，地理，基因组，RNASeqData，Saccharomyces_cerevisiae_Data，SequencingData |
| 版本 | 1.14.0 |
| 许可证 | LGPL |
| 取决于 | R (>= 2.10)，SummarizedExperiment |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | knitr，减价 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | rnaseqGene，ROCpAI |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | fission_1.14.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| macOS 10.13 (High Sierra) | |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fission |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/裂变 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/fission/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
