WGSmapp

DOI:10.18129 / B9.bioc.WGSmapp

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅WGSmapp。

Mappability追踪编码的全基因组测序项目

Bioconductor版本:3.14

这个包提供了全基因组mappability追踪人类hg19 / hg38组装。我们使用100 -即mappability跟踪从编码的项目和计算加权平均mappability相同的分数如果多个编码区域重叠。“黑名单”垃圾箱,包括音从端粒重复区域和空白参考组装,着丝粒和/或异染色质区域包括在内。数据集由三个组装本文件单细胞全基因组测序从10 x出于演示目的。

作者:如金王

维护人员:如金王<如金在email.unc.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“WGSmapp”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DNASeqData,编码,ExperimentData,基因组,Homo_sapiens_Data,SequencingData,SingleCellData
版本	1.6.0
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.6.0),GenomicRanges
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	范围
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	WGSmapp_1.6.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/WGSmapp
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ WGSmapp
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/WGSmapp/
包下载报告	下载数据