TENxVisiumData

DOI:10.18129 / B9.bioc.TENxVisiumData

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅TENxVisiumData。

Visium空间通过10倍基因组基因表达数据

Bioconductor版本:3.14

收集Visium空间10 x基因组学,基因表达数据集类SpatialExperiment格式化为对象。数据覆盖各种生物和组织,包括:单一和多节实验,以及单一部分进行全转录组和有针对性的面板分析。数据集可能用于测试示例包,教程和工作流的示威活动,或类似的目的。

作者:海伦娜·l·Crowell (aut (cre)

维护人员:海伦娜·l·Crowell <海伦娜在crowell.eu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“TENxVisiumData”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes (“TENxVisiumData”)

HTML	R脚本	TENxVisiumData
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	ExperimentData,ExperimentHub,ExpressionData,Homo_sapiens_Data,Mus_musculus_Data,ReproducibleResearch
版本	1.2.0
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	ExperimentHub,SpatialExperiment
进口	跑龙套
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/helenalc/TENxVisiumData
BugReports	https://github.com/helenalc/TENxVisiumData/issues
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	TENxVisiumData_1.2.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TENxVisiumData
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ TENxVisiumData
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/TENxVisiumData/
包下载报告	下载数据