SCATEData

DOI:10.18129 / B9.bioc.SCATEData

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SCATEData。

数据SCATE(单细胞ATAC-seq信号提取和增强)

Bioconductor版本:3.14

SCATEData是SCATE ExperimentHub包是一个软件工具,提取和提高稀疏和离散单细胞ATAC-seq信号。

作者:至诚霁(aut)、周(aut) Wenpin侯(cre, aut),Hongkai霁(aut)

维护人员:Wenpin侯< wp。在gmail.com hou3 >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“SCATEData”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“SCATEData”)

HTML	R脚本	1。SCATEData包
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	ExperimentData,ExperimentHub
版本	1.4.0
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	ExperimentHub,GenomicAlignments,GenomicRanges、基础
进口	跑龙套
链接
建议	knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/Winnie09/SCATEData/issues
取决于我	SCATE
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	SCATEData_1.4.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SCATEData
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SCATEData
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SCATEData/
包下载报告	下载数据