RcisTarget.hg19.motifDBs.cisbpOnly.500bp

DOI:10.18129 / B9.bioc.RcisTarget.hg19.motifDBs.cisbpOnly.500bp

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见RcisTarget.hg19.motifDBs.cisbpOnly.500bp．

RcisTarget motif数据库用于人类(hg19) - 4.6k motif的子集

Bioconductor版本:3.14

RcisTarget数据库:基于基因的motif排序和转录因子注释。该包包含4.6k motif (cisbp motifs)的子集，仅在上游和TSS的500bp内评分。请参阅RcisTarget教程下载完整的数据库，包含20k个主题和搜索空间高达10kbp围绕TSS。

作者:Sara Aibar, Gert Hulselmans, Stein Aerts。库鲁汶大学人类遗传学中心计算生物学实验室。比利时鲁汶。

维护者:Sara Aibar < Sara。Aibar at kuleuven.vib.be>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" rcistarget .hg19. motifdb . cisbponly .500bp")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ExperimentData,Homo_sapiens_Data
版本	1.14.0
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.3)
进口	data.table
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL	http://scenic.aertslab.org
全靠我
进口我
建议我	RcisTarget
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	RcisTarget.hg19.motifDBs.cisbpOnly.500bp_1.14.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RcisTarget.hg19.motifDBs.cisbpOnly.500bp
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ rcistarget .hg19. motifdb . cisbponly .500bp
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RcisTarget.hg19.motifDBs.cisbpOnly.500bp/
软件包下载报告	下载数据