NxtIRFdata

DOI:10.18129 / B9.bioc.NxtIRFdata

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅NxtIRFdata。

数据NxtIRF

Bioconductor版本:3.14

NxtIRFdata NxtIRF同伴包,这是一个IRFinder -基于R包内含子保留,可变剪接RNA-seq BAM文件定量。NxtIRFdata包含人类和小鼠的生成所需的Mappability文件引用。NxtIRFdata还包含一个合成基因组参考和用于测试NxtIRF BAM例子文件。BAM文件是基于6提供的Leucegene数据集样本NCBI基因表达综合下加入GSE67039数量。

作者:亚历克斯芽黄黑(cre, aut cph], Ulf施密茨(施)

维修工:亚历克斯芽黄黑<。黄在centenary.org.au >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“NxtIRFdata”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“NxtIRFdata”)

HTML	R脚本	NxtIRFdata: NxtIRF的数据包
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	ExperimentData,ExperimentHub,ExpressionData,基因组,PackageTypeData,RNASeqData
版本	1.0.0
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于
进口	ExperimentHub,BiocFileCache,rtracklayer,R.utils
链接
建议	testthat(> = 3.0.0),knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/alexchwong/NxtIRFdata
BugReports	https://support.bioconductor.org/
取决于我	NxtIRFcore
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	NxtIRFdata_1.0.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NxtIRFdata
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ NxtIRFdata
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/NxtIRFdata/
包下载报告	下载数据