MouseGastrulationData

DOI:10.18129 / B9.bioc.MouseGastrulationData

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MouseGastrulationData。

单细胞跨鼠标原肠胚形成和器官发生早期组学数据

Bioconductor版本:3.14

提供原始计算数据处理和单细胞RNA序列,单细胞ATAC-seq, seqFISH(空间转录组)实验沿着timecourse鼠标执行原肠胚形成和早期器官形成。

作者:乔纳森·格里菲思(aut (cre),亚伦Lun (aut)

维修工:乔纳森·格里菲思< jonathan.griffiths。94年gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MouseGastrulationData”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“MouseGastrulationData”)

HTML	R脚本	可用的数据集
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ExperimentData,ExperimentHub,ExpressionData,Mus_musculus_Data,RNASeqData,SequencingData,SingleCellData
版本	1.8.0
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.1),SingleCellExperiment,SummarizedExperiment,SpatialExperiment
进口	方法,ExperimentHub,BiocGenerics,S4Vectors,BumpyMatrix
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/MarioniLab/MouseGastrulationData
BugReports	https://github.com/MarioniLab/MouseGastrulationData/issues
取决于我	OSCA.multisample
进口我
建议我	miloR
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	MouseGastrulationData_1.8.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MouseGastrulationData
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MouseGastrulationData
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MouseGastrulationData/
包下载报告	下载数据