这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MetaGxPancreas。
Bioconductor版本:3.14
胰腺癌转录组数据集的集合,是MetaGxData计划纲要的一部分。这个包包含多个胰腺癌症数据集,从各种资源下载,变成SummarizedExperiment对象。作者如何规范化数据的细节可以在实验数据的对象。此外,位置可以找到的数据得到的url变量实验数据部分每个SE。
作者:迈克尔·佐恩(aut),这个镇Sandhu (aut),克里斯托弗•伊尔斯[所有]便雅悯Haibe-Kains (aut (cre)
维护人员:本杰明Haibe-Kains < benjamin.haibe。实物地租在utoronto.ca >
从内部引用(R,回车引用(“MetaGxPancreas”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MetaGxPancreas”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“MetaGxPancreas”)
HTML | R脚本 | MetaGxPancreas:一个包胰腺癌基因表达分析 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ArrayExpress,CancerData,ExperimentData,ExperimentHub,ExpressionData,地理,Homo_sapiens_Data,MicroarrayData,NCI,SequencingData |
版本 | 1.14.0 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | SummarizedExperiment,ExperimentHubR (> = 3.6.0) |
进口 | 统计数据,嫁祸于,S4Vectors,AnnotationHub |
链接 | |
建议 | testthat,knitr,BiocStyle,rmarkdown,减价 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | MetaGxPancreas_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13(高山脉) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MetaGxPancreas |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MetaGxPancreas |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MetaGxPancreas/ |
包下载报告 | 下载数据 |