LRcellTypeMarkers

DOI:10.18129 / B9.bioc.LRcellTypeMarkers

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅LRcellTypeMarkers。

标志基因信息LRcell R Bioconductor包

Bioconductor版本:3.14

这是一个外部为LRcell ExperimentData包。这个数据包包含基因富集得分计算从scRNA-seq数据集显示每个细胞类型的基因富集在特定的大脑区域。LRcell包是用来识别特定sub-cell类型驱动的变化观察大部分RNA-seq差异基因表达的实验。有关详细信息,请访问:https://github.com/marvinquiet/LRcell。

作者:文静马(cre, aut)

维护人员:文静马<文静。马在emory.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“LRcellTypeMarkers”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“LRcellTypeMarkers”)

HTML	R脚本	LRcellTypeMarkers:标志基因信息使用Bioconductor ExperimentHub LRcell R Bioconductor包
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	ExperimentData,ExperimentHub,ExpressionData,PackageTypeData,RNASeqData,SingleCellData
版本	1.2.0
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 4.1)
进口	ExperimentHub
链接
建议	LRcell,BiocStyle,knitr,rmarkdown,roxygen2,testthat
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/marvinquiet/LRcellTypeMarkers/issues
取决于我
进口我
建议我	LRcell
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	LRcellTypeMarkers_1.2.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/LRcellTypeMarkers
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ LRcellTypeMarkers
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/LRcellTypeMarkers/
包下载报告	下载数据