HMP16SData

DOI:10.18129 / B9.bioc.HMP16SData

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅HMP16SData

从人类微生物组16 s rRNA测序数据项目

Bioconductor版本:3.14

HMP16SData是Bioconductor ExperimentData包人类微生物组的项目(HMP) 16 s rRNA测序数据变量地区1 - 3和3 - 5。原始数据文件提供的包从HMP下载数据分析和协调中心。处理过的数据是通过ExperimentHub SummarizedExperiment类对象。

作者:卢卡斯希弗(aut (cre)Rimsha Azhar (aut),马塞尔•拉莫斯(施),路德维希Geistlinger[所有],李维沃尔德伦(aut)

维护人员:卢卡斯希弗<希弗。卢卡斯在gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“HMP16SData”)):

安装

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“HMP16SData”)

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HTML R脚本 HMP16SData
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews ExperimentData,ExperimentHub,Homo_sapiens_Data,MicrobiomeData,ReproducibleResearch,SequencingData
版本 1.14.0
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 4.1.0),SummarizedExperiment
进口 AnnotationHub,ExperimentHub,S4Vectors,为了,dplyr,kableExtra,knitr,magrittr、方法、readr,stringr,宠物猫,跑龙套
链接
建议 Biobase,BiocCheck,BiocManager,BiocStyle,circlize,cowplot,dendextend,devtools,ggplot2,gridExtra,,phyloseq,rmarkdown,roxygen2统计数据,testthat,tidyr
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/waldronlab/HMP16SData
BugReports https://github.com/waldronlab/HMP16SData/issues
取决于我
进口我
建议我 benchdamic
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包档案

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源包 HMP16SData_1.14.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HMP16SData
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ HMP16SData
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/HMP16SData/
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