GSE103322

DOI:10.18129 / B9.bioc.GSE103322

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GSE103322。

加入地理数据GSE103322 SingleCellExperiment

Bioconductor版本:3.14

5902个细胞单细胞RNA-Seq数据从18岁患者口腔头颈部鳞状细胞癌可加入地理(GSE103322) (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE103322)。GSE103322数据解析成ExperimentHub SincleCellExperiment对象可用。

作者:马里亚诺·阿尔瓦雷斯(aut (cre)

维修工:马里亚诺·阿尔瓦雷斯< reef103 gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“GSE103322”)

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文档

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HTML	R脚本	使用Bioconductor ExperimentHub scRNASeq HNSC数据
PDF		参考手册

细节

biocViews	CancerData,DNASeqData,ExperimentData,ExperimentHub,ExpressionData,地理,基因组,Homo_sapiens_Data,RNASeqData,SingleCellData
版本	1.0.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	Biobase,GEOquery
进口
链接
建议	ExperimentHub(> = 0.99.6),knitr,BiocStyle,rmarkdown,SummarizedExperiment,SingleCellExperiment
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	GSE103322_1.0.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GSE103322
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GSE103322
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GSE103322/
包下载报告	下载数据