DropletTestFiles

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅DropletTestFiles。

测试文件为单细胞滴实用工具

Bioconductor版本:3.14

生成各种文件从droplet-based单细胞协议,用于在DropletUtils测试功能。主要用于存储文件,直接处理管道的10倍基因组学”CellRanger软件,形成之前SingleCellExperiment对象。不像其他的包,这不是旨在提供对象立即准备分析。

作者:亚伦Lun(施,cre)

维护人员:亚伦Lun < infinite.monkeys.with。键盘在gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“DropletTestFiles”)):

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“DropletTestFiles”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“DropletTestFiles”)

HTML	R脚本	测试文件droplet-based单细胞实用工具
PDF		参考手册

biocViews	ExperimentData,ExperimentHub,ExpressionData,RNASeqData,SequencingData,SingleCellData
版本	1.4.0
许可证	GPL-3
取决于
进口	跑龙套,ExperimentHub,AnnotationHub,S4Vectors
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat,DropletUtils
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	OSCA。先进,OSCA.intro OSCA.workflows
进口我
建议我	DropletUtils
我的链接
构建报告

遵循bob 体育网址指示在R会话中使用这个包。

源包	DropletTestFiles_1.4.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DropletTestFiles
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DropletTestFiles
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DropletTestFiles/
包下载报告	下载数据

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