ConnectivityMap

DOI:10.18129 / B9.bioc.ConnectivityMap

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ConnectivityMap。

功能之间的连接药物、基因和疾病所揭示的常见基因表达的变化

Bioconductor版本:3.14

Broad研究所的连接图(cmap02)是一个“大型参考目录培养的人类细胞的基因表达数据的摄动与许多化学物质和基因试剂”,包含超过7000个基因表达谱和1300小分子。

作者:保罗·香农

维修工:保罗·香农< pshannon systemsbiology.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ConnectivityMap”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	CancerData,ExperimentData,MicroarrayData
版本	1.30.0
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 2.15.1)
进口
链接
建议	RUnit,BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	ConnectivityMap_1.30.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ConnectivityMap
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ConnectivityMap
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ConnectivityMap/
包下载报告	下载数据