excluderanges

DOI:10.18129 / B9.bioc.excluderanges

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅excluderanges。

基因组的坐标有问题的基因组区域

Bioconductor版本:3.14

基因组的坐标问题基因组区域应该避免在处理基因数据。农庄组织排斥地区(原名黑名单),着丝粒,端粒,异染色质区域,等等。(UCSC的“差距”表数据)。主要是为人类和小鼠基因组,hg19 / hg38和mm9 / mm10基因组装配。

作者:米哈伊尔Dozmorov (aut (cre)埃里克·戴维斯(aut) Wancenμ(aut),斯图尔特·李(aut)蒂姆Triche (aut),道格拉斯Phanstiel (aut),迈克尔·爱(aut)

维修工:米哈伊尔Dozmorov <米哈伊尔。在gmail.com dozmorov >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“excluderanges”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“excluderanges”)

HTML	R脚本	excluderanges
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	AnnotationData,AnnotationHub,FunctionalAnnotation,GenomicSequence
版本	0.99.6
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于
进口
链接
建议	BiocStyle,knitr,RefManageR,rmarkdown,rCGH,sessioninfo,AnnotationHub
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/mdozmorov/excluderanges
BugReports	https://github.com/mdozmorov/excluderanges/issues
取决于我
进口我
建议我	nullranges
我的链接

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	excluderanges_0.99.6.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/excluderanges/
包下载报告	下载数据